En Savage Minds encontramos un excelente post enfocado a la creación de cursos online con herramientas totalmente gratuitas. Estas son las que recomiendan:

(Nota: los enlaces apuntan a ejemplos creados por Savage Minds)

Writely, para publicar el Programa del Curso
Box, para subir todos los documentos a un directorio y hacerlo público
Google Groups, para crear un grupo de discusión y lista de correo
Google Spreadsheets, para la lista de participantes
Del.icio.us, para crear un tag específico para la urls que quieras compartir con los alumnos.